双因子杂种（dihybrid）亦称双基因杂种。二对等位基因不同的两亲间的杂种。F1群体中表型是均一的。根据这二个等位基因是独立分配的还是相互连琐的，以及显隐性的关系，而F2的分离比可以有各种各样的变化（参见分离）。各个等位基因都呈完全显性，且二者完全连琐时，F2中的分离比与单因子杂种的分离比一样都是3∶1，若这二个等位基因位于非同源染色体上，则分离比为9∶3∶3∶1，由于交换而导致连琐不完全时，分离比乱。1
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