结核菌随粪便排出，引起肛门周围炎症而发展成肛瘘。因此有人认为肛瘘是结核性的，治疗起来比较困难，普遍认为肛瘘原因为结核是个极大的错误，对年轻人提起结核的话有许多人都不知其为何物。 结核性疾病在我国较多见，因此结核性肛瘘在我国也不少见。结核菌是一种很麻烦的细菌，它可以在令人意想不到的部位致病，如中耳炎、生殖器炎症、肠结核等，肛瘘是其中之一。 结核已不再是令人恐惧的疾病，经过治疗是完全可以治愈的。
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